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厌氧处理根据代谢过程中对氧的需求情况，微生物可以分为好氧微生物、厌氧微生物和介于二者之间的兼性微生物，因此，相应的污水处理工艺也可以分为三大类。好氧生物处理利用好氧微生物的代谢活动来处理废水，它需要不断向废水中补充大量空气或氧气，以维持其中好氧微生物所需要的足够的溶解氧浓度。
在好氧条件下，有机物最终被氧化为水和二氧化碳等，厌氧处理，部分有机物被微生物同化以产生新的微生物细胞，厌氧处理系统，活性污泥法、生物转盘法和好氧滤器等都属于好氧处理工艺。厌氧处理则利用厌氧微生物的代谢过程，在无需提供氧气的情况下把有机物转化为无机物和少量的细胞物质，这些无机物主要包括大量的生物气（即沼气）和水。
厌氧处理产yi酸阶段：在产氢产yi酸菌的作用下，上一阶段的产物被进一步转化为yi酸、氢气、碳酸以及新的细胞物质。
厌氧处理甲烷阶段：这一阶段，yi酸、氢气、碳酸、甲酸和jia醇被转化为甲烷、二氧化碳和新的细胞物质。
甲烷xi菌将yi酸、yi酸盐、二氧化碳和氢气等转化为甲烷的过程有两种生理上不同的产甲烷菌完成，一组把氢和二氧化碳转化成甲烷，另一组从yi酸或yi酸盐脱羧产生甲烷，前者约占总量的1/3，后者约占2/3。在甲烷的形成过程中，主要的中间产物是甲基辅酶M（CH3-S-CH2-SO3-）。
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